Table of results for automatic protein check

Results for modeling_eg_1.pdb

All residue values

Table of numeric residue values

VOL-SCORE: Analysis of atomic volumes by PROVE
ANGCHK: Bond angles by WHAT IF
BNDCHK: Bond lengths by WHAT IF
BMPCHK: Van der Waals overlap verification by WHAT IF
FLPCHK: Backbone oxygen position verification by WHAT IF
PLNCHK: Side chain planarity check by WHAT IF
PC2CHK: Proline puckering phase analysis by WHAT IF
NQACHK: New Directional Atomic Contact Analysis by WHAT IF
QUACHK: Directional Atomic Contact Analysis by WHAT IF
ROTCHK: Sidechain rotamer normality check by WHAT IF
CHICHK: Torsion angle check by WHAT IF

residue	VOL-SCORE	ANGCHK	BNDCHK	BMPCHK	FLPCHK	PLNCHK	PC2CHK	NQACHK	QUACHK	ROTCHK	CHICHK
1-SER		0.73	1.44					-0.51	-2.29
2-LEU	2.50	0.99	0.62					-1.07	-1.80		-1.12
3-SER	-1.80	1.05	0.95		0.38			5.53	5.41	0.89	1.29
4-ASP	-0.80	1.81	0.98		0.67	1.26		0.66	1.30	0.86	0.58
5-ALA	6.50	0.69	0.97		0.25			0.78	1.51		1.35
6-ASP	1.40	0.98	0.94		0.23	2.49		0.97	1.47	0.79	1.89
7-LYS	3.30	0.88	0.97		0.27			1.79	1.95	0.51	2.75
8-LYS	0.20	1.20	0.90		0.22			1.78	2.10	0.50	2.18
9-ALA	0.80	0.70	0.97		0.28			0.72	0.66		1.57
10-LEU	5.90	3.58	1.16		0.25			-0.42	1.02	0.61	-0.15
11-ASP	1.20	1.30	0.98		0.27	1.06		0.27	1.55	0.78	1.84
12-ALA	1.90	0.69	0.80		0.28			1.17	0.46		1.37
13-SER	-0.60	0.97	0.93		0.42			1.24	-0.21	0.45	1.30
14-TRP	-2.90	2.76	3.62	0.16	0.43	2.95		0.85	1.20	0.50	1.01
15-LYS	0.50	1.22	0.82		0.29			0.56	1.36	0.54	0.42
16-LYS	0.80	1.19	1.05		0.28			1.32	-0.04	0.51	2.27
17-LEU	0.40	0.93	0.94		0.39			-0.13	-1.61	0.66	2.16
18-THR	-1.60	1.88	0.78	0.05	0.41			-1.28	-3.40	0.55	1.30
19-ALA	0.10	1.09	0.95		0.83			-1.61	-3.08		0.04
20-GLY	5.70	2.12	1.12					-0.57	2.23		-1.86
21-ALA	2.10	1.11	0.90					-1.33	-1.81		-1.45
22-ASP	2.20	2.60	2.35	0.03		0.47		-0.53	1.33		-1.26
23-GLY	17.30	1.42	2.63		0.78			-1.22	-1.44		0.68
24-LYS	26.30	1.32	1.10					-1.39	-5.20	0.58	0.07
25-LYS	-2.00	2.83	3.35	0.03				-0.68	-3.56		0.61
26-ASN	0.10	3.12	2.27			1.99		0.43	-2.54		-0.39
27-ALA	-2.00	0.75	0.84	0.03				0.09	0.29		0.90
28-GLY	-2.70	1.47	3.70	0.30	0.28			0.23	0.94		1.02
29-ILE	1.80	2.07	1.98	0.08	0.16			0.92	2.48	0.96	1.59
30-ASN	-1.20	3.71	0.78	0.24	0.30	3.14		0.41	0.43	0.74	0.80
31-LEU	4.60	2.52	0.93	0.20	0.29			-0.56	0.06	0.56	0.27
32-VAL	1.50	3.11	0.83	0.21	0.26			0.32	0.84	0.90	-1.43
33-LEU	2.70	1.99	1.61	0.15	0.26			0.86	0.89	0.58	0.55
34-TRP	3.10	3.05	2.72	0.64	0.24	2.85		0.83	-0.39	0.57	1.37
35-MET	-2.10	1.71	0.94	1.29	0.35			-0.51	-0.03	0.68	-0.43
36-PHE	-3.10	1.96	2.64	1.55	0.31	2.25		0.83	-0.54	0.55	0.77
37-ALA	0.10	1.17	0.73		0.44			-0.86	-2.48		1.39
38-ASN	-1.00	2.38	3.08	0.64	0.50	0.43		-1.51	-5.44	1.00	1.53
39-VAL	-1.70	4.20	1.87	0.39				-1.50	-1.81	0.69	-1.79
40-PRO	-0.80	1.08	1.71		0.54			-0.27	-0.94		0.39
41-ASN	-1.30	1.71	1.37	0.08	0.47	1.86		-1.27	-1.68	0.80	-0.19
42-MET	-4.40	9.49	1.31	1.89	0.51			-1.58	-1.73		0.62
43-ARG	1.80	1.59	1.00	0.06	0.47	0.14		-0.85	-1.85	0.73	1.39
44-ALA	0.40	1.18	0.84	0.01				-1.46	-1.83		-0.03
45-GLN	0.90	3.59	3.38	0.50	0.49	0.12		-1.99	-4.97	0.79	0.27
46-PHE	-2.60	1.37	1.20	0.41		0.54		0.33	1.98		0.25
47-SER	7.30	1.55	1.06		0.53			0.62	-0.75	0.75	1.24
48-LYS	-0.90	1.38	0.83		0.81			-0.16	-4.03	0.52	0.13
49-PHE	-2.90	1.77	0.71	1.11	0.52	1.05		-0.08	0.71	1.00	-1.11
50-ASN	-0.40	1.98	1.29	0.01		4.08		-0.85	-3.77		0.38
51-ALA	5.30	1.66	0.92		0.50			0.02	-1.86		-1.41
52-ASN	1.10	2.20	1.48	0.24		0.11		-0.51	-2.87	0.58	0.89
53-GLN	12.10	1.81	1.22			0.07		-0.34	-3.58		0.84
54-SER	-0.80	0.52	0.74					1.33	3.96	0.53	0.67
55-ASP	3.50	1.68	1.00		0.38	1.36		-0.14	1.26	0.67	1.13
56-ASP	2.10	1.41	1.08		0.34	2.12		2.85	-0.35	0.74	1.34
57-ALA	4.50	0.91	0.95		0.18			-0.37	-0.32		0.83
58-LEU	2.00	0.88	0.96		0.30			-0.61	-1.53	0.62	1.95
59-LYS	1.10	1.19	0.84		0.82			0.08	-2.83	0.51	1.04
60-GLY	0.90	1.00	1.66		0.51			-0.86	-4.22		-0.31
61-ASP	1.70	0.95	0.69		0.65	5.78		0.30	4.62	0.56	-0.03
62-ALA	7.60	0.99	1.17		0.47			1.65	2.00		1.51
63-GLU	-0.50	1.61	0.98		0.31	1.55		-0.26	1.15	0.66	1.19
64-PHE	-3.10	4.38	1.51	0.92	0.24	0.34		0.57	2.78	0.56	2.06
65-ILE	0.20	3.25	1.33	0.12	0.53			-0.92	0.07	0.95	-1.68
66-LYS	-0.30	2.04	1.17		0.36			2.19	1.62	0.53	2.17
67-GLN	-2.40	1.84	0.72	0.02	0.21	0.06		-0.12	1.12	0.62	0.71
68-VAL	-3.90	8.13	0.92	0.47	0.15			-0.29	0.57	0.91	-0.62
69-ASN	4.50	2.38	0.78		0.31	0.41		0.26	0.99	0.80	0.86
70-VAL	0.70	2.24	0.92		0.27			-0.13	0.19	0.90	-1.18
71-ILE	-2.10	2.53	1.21	0.13	0.20			0.67	0.56	0.95	0.45
72-VAL	0.30	2.70	0.61	0.11	0.24			-0.02	0.19	0.91	-0.68
73-ALA	-0.40	0.81	0.87		0.29			1.18	0.08		1.56
74-ALA	2.40	0.69	0.97		0.29			0.46	-0.38		1.57
75-LEU	-0.90	0.75	0.82		0.25			1.96	0.12	0.66	1.85
76-ASP	-1.70	0.81	0.68		0.29	0.64		0.43	0.47	0.78	1.18
77-GLY	1.30	1.14	1.55		0.21			1.17	0.08		1.08
78-LEU	-2.00	1.60	0.54	0.18	0.34			0.03	0.85	0.58	0.08
79-LEU	4.10	2.60	1.00	0.11	0.36			-1.33	-0.91	0.58	-0.23
80-GLN	-0.20	1.18	0.92		0.55	0.60		-0.61	-3.92	0.61	0.73
81-SER	1.50	0.68	0.79		0.76			-0.60	1.34	0.76	-1.17
82-VAL	3.00	1.57	1.14					-1.74	-2.15		-0.94
83-ASN	1.90	1.84	0.93		0.47	0.98		-0.32	-4.30	0.59	1.54
84-ASN	1.60	2.63	1.94	0.25		3.34		0.81	-0.39		-0.79
85-PRO	1.50	1.73	0.89		0.46			0.53	1.39		-0.04
86-GLY	18.90	1.32	1.73		0.31			0.82	1.06		1.08
87-GLN	-0.80	1.80	1.19	0.25	0.25	0.43		0.20	0.87	0.60	0.72
88-LEU	2.40	2.31	0.66		0.27			0.77	0.96	0.62	0.54
89-GLN	-0.10	1.29	1.08		0.24	0.31		1.23	1.43	0.61	2.14
90-ALA	1.60	0.76	0.84		0.36			1.05	1.32		1.37
91-ASN	-1.70	1.34	0.87		0.43	0.39		0.78	-0.27	0.81	1.11
92-LEU	-0.80	1.32	0.72		0.31			2.08	1.85	0.65	1.49
93-ASP	-0.80	0.93	0.72		0.28	0.72		0.97	0.12	0.78	1.19
94-LYS	1.50	1.18	1.12		0.27			0.39	-1.12	0.59	1.43
95-LEU	-1.30	1.89	0.98		0.38			-0.38	-1.47	0.85	-0.03
96-ALA	-1.10	1.87	0.91		1.48			-0.58	-0.68		-0.59
97-LYS	-1.80	1.57	1.15	0.19				-1.43	-2.42	0.88	-0.36
98-SER	-0.80	4.05	0.76					-0.87	-0.81	0.93	-0.71
99-HIS	4.00	3.79	2.74	0.19		0.39		-1.85	-2.82		0.79
100-VAL	1.50	3.46	1.82	0.01	0.61			-1.99	-2.73	0.71	-1.63
101-ASN	0.30	0.93	0.93	0.01		0.40		-1.61	-4.30	0.93	1.06
102-LEU	2.10	1.24	0.84					-0.97	-2.73	0.71	0.52
103-LYS	-0.10	1.59	0.96					0.08	-4.21		0.15
104-ILE	-2.40	3.02	1.61	0.67	0.68			-1.10	-1.29	0.88	-0.29
105-GLY	-0.80	1.43	1.94		1.07			-0.53	1.40		-0.85
106-LEU	-0.60	1.59	0.96					-1.51	-0.60		1.32
107-GLU	14.00	6.79	2.26	0.20	0.57	1.37		-2.60	-2.59	0.60	-0.03
108-PHE	0.90	4.94	2.18	0.09	0.50	0.28		-1.04	-3.63	0.56	1.68
109-PHE	1.50	3.60	1.29	0.17	0.38	1.10		0.41	-1.18	0.55	2.32
110-GLY	2.90	1.35	2.44		0.29			1.02	0.69		-0.06
111-PRO	-1.10	5.85	2.58	0.21	0.32			-1.96	-0.43		0.33
112-LEU	-1.60	2.26	0.99	0.39	0.22			1.82	1.28	0.65	0.36
113-GLN	2.50	5.43	1.22	0.13	0.21	4.70		-0.30	1.11	0.64	0.91
114-GLN	1.60	2.20	1.09		0.25	2.86		-0.42	1.01	0.61	0.70
115-ASN	2.70	1.57	1.01		0.24	0.50		-0.50	0.87	0.76	2.47
116-ILE	1.10	0.97	0.79		0.15			0.50	1.95	0.96	1.14
117-HIS	-1.10	3.30	2.56		0.25	0.41		0.04	1.59	0.50	1.33
118-SER	-0.50	1.35	0.86		0.30			0.92	1.59	0.44	1.38
119-PHE	2.70	5.19	1.08	0.45	0.24	2.01		0.97	2.15	0.56	1.57
120-ILE	4.10	1.29	1.17	0.11	0.20			0.02	0.02	0.96	0.23
121-GLU	-0.30	2.23	0.78	0.07	0.34	0.40		-0.30	-2.16	0.66	0.88
122-SER	-0.90	0.76	0.98		0.36			1.72	-2.59	0.47	1.24
123-ALA	0.60	1.00	0.68		0.51			-0.58	-3.47		-0.15
124-LEU	2.30	1.27	1.03		0.71			-0.93	-0.72	0.94	-1.40
125-GLY	5.80	1.23	1.75					-0.73	-2.97		0.06
126-VAL	26.40	1.58	1.43		0.74			-1.94	-3.72		-1.17
127-GLY	2.60	0.34	1.70		1.36			-1.40	-3.49		-2.10
128-ALA	-0.20	1.62	0.95					-0.74	-2.25		-1.44
129-GLY	27.50	3.19	3.57	0.12				-0.84	-0.20		0.83
130-SER	24.80	1.39	2.93		0.52			0.07	0.17	0.61	-0.51
131-ASP	0.40	0.94	1.10	0.03	0.38	0.04		0.39	-1.54	0.66	1.01
132-GLU	-1.60	3.12	1.37		0.34	0.24		-1.44	0.31	0.69	0.53
133-PRO	-3.20	4.59	1.66	0.09	0.23		PUCPHASE	-1.86	-1.23		-1.08
134-LYS	-0.90	1.83	0.99		0.30			1.12	-0.04	0.55	1.70
135-ALA	2.70	0.77	0.93		0.31			0.91	-0.44		1.30
136-TRP	3.30	3.36	3.48	0.05	0.17	1.03		1.09	1.34	0.57	1.40
137-GLY	-0.50	2.11	2.21	0.04	0.38			2.05	1.04		0.93
138-ASN	-0.70	2.21	0.82		0.24	1.15		0.84	1.34	0.78	1.64
139-LEU	1.80	1.63	0.58	0.25	0.25			0.19	1.15	0.66	0.36
140-ILE	2.00	8.79	0.82	0.12	0.16			-0.22	0.54	0.95	-1.20
141-ALA	-0.10	1.60	0.40		0.19			0.06	-0.14		1.27
142-ALA	0.30	0.78	0.72		0.25			-0.27	-1.48		1.25
143-PHE	-2.30	0.86	1.53	0.49		0.69		-0.17	-4.31		1.04
144-ASN	0.00	3.22	1.01			0.33		0.50	-5.43

Values printed in italics are "poor", values in boldface are "bad"